Données d'ADN environnemental (eDNA) provenant de la Garde côtière canadienne Sir John Franklin, de la NOAA Bell M. Shimada et du R/V TINRO lors de l'expédition panpacifique hivernale en haute mer de l'Année internationale du saumon 2022

10.5061/dryad.c2fqz61nn

Ensemble de données de variants de séquences d'amplicons (asv) issu d'une analyse de l'ADN environnemental par métabarcodage à barres multi-amplicons lors de l'expédition Signature de l'Année internationale du saumon dans le Pacifique Nord-Est en février/mars 2022. Un tableau de tous les asv générés dans l'étude est fourni dans ASV.csv, ventilé par amplicon et échantillon et répertoriant la présence dudit asv dans ledit échantillon. De plus, le nombre total de lectures par amplicon/bac d'échantillons est enregistré ainsi qu'une attribution taxonomique. Notez que ces données sont fournies avant le filtrage. Par exemple, les lectures d' « Homo sapiens » sont abondantes et doivent être considérées comme une contamination. Les métadonnées des stations d'échantillonnage sont fournies dans le fichier sample_metadata.csv qui contient la date, lat/long, ainsi que des métadonnées environnementales détaillées associées à l'échantillon. Reportez-vous à Deeg et coll. « Les modèles spatiotemporels de l'utilisation de l'habitat hivernal du saumon dans le Pacifique Nord-Est découverts par l'ADN environnemental » ICES Journal of Marine Science 2025 (https://doi.org/10.1093/icesjms/fsaf104) pour des informations détaillées sur le prélèvement d'échantillons, le séquençage et le traitement bioinformatique.

Accès et utilisation

Licence: CC0 1.0

Données et ressources

Citation

Relationships

Mots clés

Étendue du jeu de données

Date(s) de référence des métadonnées novembre 05, 2025 (Publication)
novembre 05, 2025 (Revision)
Date(s) de référence des données février 05, 2022 (Création)
Fréquence de mise à jour Au besoin

Partie responsable 1
Affiliation
North Pacific Anadromous Fish Commission ROR logo
Courriel
secretariat@npafc.org
Rôle
Éditeur
Partie responsable 2
Nom
Deeg, Christoph
Affiliation
Fisheries and Oceans Canada ROR logo
Courriel
Christoph.Deeg@dfo-mpo.gc.ca
Rôle
  • Auteur
  • Dépositaire
  • Propriétaire
  • Point de contact
  • Chercheur principal
Partie responsable 3
Nom
Tam, Christopher
Affiliation
Department of Fisheries and Oceans ROR logo
Rôle
  • Auteur
  • Chercheur principal
Partie responsable 4
Nom
Esenkulova, Svetlana
Affiliation
Pacific Salmon Foundation ROR logo
Rôle
  • Auteur
  • Chercheur principal
Partie responsable 5
Nom
Wells, Abi
Affiliation
National Oceanic and Atmospheric Administration ROR logo
Courriel
abigail.wells@noaa.gov
Rôle
  • Auteur
  • Chercheur principal
Partie responsable 6
Nom
Soshnina, Valeriia
Affiliation
All-Russian Research Institute Fisheries and Oceanography ROR logo
Rôle
  • Auteur
  • Chercheur principal
Partie responsable 7
Nom
Ens, Nicholas
Affiliation
University of Victoria ROR logo
Rôle
  • Auteur
  • Chercheur principal
Partie responsable 8
Nom
Schulze, Angela
Affiliation
Department of Fisheries and Oceans ROR logo
Rôle
  • Auteur
  • Chercheur principal
Partie responsable 9
Nom
Miller-Saunders, Kristi ORCID logo
Affiliation
Fisheries and Oceans Canada ROR logo
Courriel
kristi.saunders@dfo-mpo.gc.ca
Rôle
  • Auteur
  • Chercheur principal
Partie responsable 10
Affiliation
Hakai Institute ROR logo
Courriel
data@hakai.org
Rôle
Distributeur

Champ Valeur
Variables océaniques
  • Biomasse et diversité phytoplanctonique
  • Biomasse et diversité zooplanctonique
  • Abondance et diversité de poissons
  • Biomasse et diversité microbienne
  • Abondance et distribution de tortues, oiseaux et mammifères marins
  • Composition et couverture des coraux durs
  • Composition et couverture des herbiers marins
  • Composition et couverture de la canopée de macroalgues
  • Abondance et distribution des invertébrés
Portée Jeu de données
Statut Terminé
Associated Datasets
Associated Datasets 1
Parent or Linked Dataset Title
Spatiotemporal patterns of salmon winter habitat usage in the Northeast Pacific uncovered by environmental DNA
Parent or Linked Dataset identifier
https://doi.org/10.1093/icesjms/fsaf104
Association Type
crossReference
Note de maintenance Generated from https://hakaiinstitute.github.io/hakai-metadata-entry-form#/en/iys/8uVZo4FfAIdLqGWmrgPsQ1Jfs9P2/-NUcx5QqllIa_q2ZWszT
Étendue spatiale [[[-146.987533333333, 58.0061833333333], [-143.837716, 57.008466], [-140.978466, 56.93305], [-134.904316, 52.9722], [-132.11135, 50.950383], [-126.385166666667, 47.7898833333333], [-130.6276, 46.7975], [-135.001416666667, 45.0000166666667], [-167.1688, 45.3843], [-169.3867, 46.2883], [-169.40751, 46.29369], [-171.155, 47.91104], [-169.065, 49.065], [-165.1367, 50.0767], [-151.875183333333, 56.3804666666667], [-150.982833333333, 56.99215], [-146.987533333333, 58.0061833333333]]]
Latitude limite Nord 45.0000166666667
Latitude limite Sud 58.0061833333333
Longitude limite Est -126.385166666667
Longitude limite Ouest -171.155
Étendue temporelle
Début
2022-02-05
Fin
2022-03-20
Étendue verticale
Min
2.0
Max
3.0
Langue par défaut Anglais
Identifiant de citation
Code
https://doi.org/10.5061/dryad.c2fqz61nn
Included in Data Catalogue
Included in Data Catalogue 1
Nom
North Pacific Anadromous Fish Commission
Description
 
URL
https://data.npafc.org